《寶可夢朱／紫》中玩家將扮演學院轉校生，在帕底亞廣闊的地圖中自由探索，培養屬於自己的寶可夢，擊敗寶主挑戰道館成為最強寶可夢訓練師。
內容目錄
學院生活
在校園內移動前往生物教室。
與老師吉尼亞交談，得知寶可夢圖鑑的發明者正是他，隨後他會拜託我們收集圖鑑，首先需要收集30種寶可夢。
來到校長室與校長交談，他會詢問我們“蕉綠”是什麼意思。
回答完校長後會增加校長的好感度。
在醫務室中米莫莎老師會拜託我們給她講冒險中有趣的事情，交談完畢後和米莫莎的好感度上升。
學院課程
在學院大廳的櫃檯處可以選擇已經解鎖的課程，課程後的數字代表當前課程的節數。以下圖為例，生物（1）代表我們如果選擇生物將會上生物的第一節課，在第一節課結束後，再次來到選課處會變為生物（2）。
在課堂上我們可以學習到一些遊戲內的知識或者技巧。
生物
第一節生物課吉尼亞老師會詢問我們在哪裡不能帶著寶可夢一起走，正確答案是室內，但此時沒有正確答案可以選擇，因此隨便選一個就行。
第二節生物課中我們可以得知在野外野餐時，偶爾會在野餐盒中發現寶可夢蛋。
數學
泰姆老師負責學院內的數學課程教學，第一節課我們可以了解到當寶可夢的屬性相剋時，攻擊的傷害會變為2倍。
第二節課中可以得知，一次購買10個精靈球會額外獲得1個白色紀念球。
歷史
歷史課由蕾荷老師負責，第一節課我們可以了解到帕底亞的古老傳說，在巨坑底部埋藏著無數的財富。
第二節課中可以得知帕底亞帝國統治地區大概從2000年前開始。
對戰學
學院的對戰學課程由凰蘗負責，在第一節課程中可以得知寶可夢的攻擊分為物理與特殊兩種類型。
第二節課程會學習太晶團體戰的聲援效果。
家政
學院家政課程由老師薩瓦羅教授，第一節的內容為食材會影響到製作的三明治的使用效果。
第二節課的內容是在野外探索時，地上的掉落物有時會非常有用。
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